当前，我国水产品质量安全认证主要有无公害农(水)产品、绿色食品、有机产品以及水产品地理标志登记保护产品等四种基本类型。
从水平定位、产品结构、技术制度、认证方式和发展机制来看，这四种类型各有特点：
(1) 无公害农(水)产品。
产品质量达到我国普通水产品和食品标准要求，保障基本安全，满足大众消费；产品以初级食用水产品为主；
推行“标准化生产、投入品监管、关键点控制、安全性保障”的技术制度；采取产地认证与产品认证相结合的方式；认证属于公益性事业，不收取费用，实行政府推动的发展机制。
(2) 绿色食品。
产品质量安全标准整体达到发达国家先进水平，市场定位于国内大中城市和国际市场，满足于更高层次的消费；
产品以初级水产品为基础，以加工水产品为主体；推行“两端监测、过程控制、质量认证、标志管理”的技术制度；
采取质量认证与证明商标管理相结合的方式；绿色食品认证以保护农业生态环境、增进消费者健康为基本理念，不以营利为目的，收取一定的费用保障事业发展，采取政府推动与市场拉动相结合的发展机制。
(3) 有机产品。
按照有机农业方式生产，对产品质量安全不作特殊要求，满足特定消费，主要服务于出口贸易等高端市场；
产品以初级和初加工水产品为主；
强调常规农业向有机农业转换，推行基本不用化学投入品的技术制度，保护生态环境和生物多样性，维护人与自然的和谐关系；
注重生产过程监控，一般不做环境监测和产品检测，一年一认证；按照国际惯例，采取市场化运作。
(4) 水产品地理标志登记保护产品。
世界贸易组织在有关贸易的知识产权协议中，对地理标志的定义为：
地理标志是鉴别原产于一成员国领土或该领土的一个地区(或一个地点)的产品的标志，但标志产品的质量、声誉或其他确定的特性应主要决定于其原产地。
因此，地理标志主要用于鉴别某一产品的产地，是该产品的产地标志。地理标志也是知识产权的一种。
在国内有农业部、国家工商行政管理总局和国家质量监督检验检疫总局三种水产品地理标志登记保护产品。
总体而言，“三品一标”既有联系，又有区别。四者都属于水产品范畴，是水产品质量安全工作的重要内容。
无公害农(水)产品突出安全因素控制；绿色食品既突出安全因素控制，又强调产品优质与营养；
有机产品注重对影响生态环境因素的控制。“三品一标”相互衔接，互为补充，各有侧重，共同发展。
产品外包装上ISO、GAP、HACCP、GMP、SSOP的含义
ISO为质量管理体系，代表国际标准化组织。GAP、HACCP、GMP、SSOP为食品安全管理体系。
GAP即良好农业规范，是对水产品的产前、产中和产后全过程质量进行控制的规范。
HACCP(Hazard Analysis Critical Control Points)，即危害分析和关键控制点。它是食品安全控制体系，分析生产各个环节，找出具体的安全危害并通过采取有效的预防与控制措施，对各关键环节实施严格的控制，从而实现对食品安全的保障。
GMP即良好生产规范，是政府强制性的有关食品生产、加工、包装、贮存、运输和销售的卫生要求，以法律、法规、规章或管理文件等形式出现。
SSOP即卫生标准操作程序，使食品加工企业为了保证其生产操作达到GMP所规定的要求，确保加工过程中消除不良因素，使其所加工的食品符合卫生要求，指导食品生产加工过程中如何实施清洗、消毒和保持卫生的作业指导性文件。
