长江流域众多湖泊生态环境内忧外患严重。专家及沿江渔业行政管理部门呼吁以牺牲国土资源及环境质量为代价换取的渔业产量和利润是无法保持可持续发展的。这是从长江流域生态渔业与管理理论研讨会上传来的消息。
有资料表明：2002年内陆水域淡水水产品总量占全国水产品总量的42.03%，占世界淡水养殖产量的43.5%，淡水水产品占如此高的份额，这在国际上也是罕见的。这些产量都是由生态问题重重的江河湖泊承担的。仅就长江流域的湖泊而言，渔业管理内部，由各级渔业部门主管的捕捞和养殖存在缺乏长远规划、养殖开发方式不合理、破坏物种平衡过度捕捞等问题。在外部，渔业部门不可控的因素更加剧了长江流域湖泊生态环境恶化。如：水工建筑阻隔了鱼类洄游通道、各类工业污染破坏了湖泊水质、湖泊行政管理体制无法确保其有效管理等。人类对湖泊的索取已经大大超出其所能承受的限度。
2004年7月11日至12日，旨在探索长江流域湖泊生态修复方法、全方位研究湖泊管理方式的长江流域生态渔业与管理理论研讨会在湖北省武汉市召开。来自长江流域渔政行政管理部门的领导和中科院水生所、长江所、测量与地球物理研究所、水库渔业研究所、淡火渔业研究中心的专家汇聚一堂，与世界自然基金会长江项目办公室的官员们一起，共同研讨长江流域湖泊生态渔业管理。凝聚着专家学者两年来科研成果的32篇论文被提交，18篇论文在会上宣讲。会议为各级渔业行政主管部门和渔政管理部门、科研机构的专家提供了一个交流和切磋的平台，集诸家之长共同探索保护长江流域湖泊生态资源、改善渔业生产模式的有效途径。会议由长江渔业资源管理委员会办公室主任俞国平主持，长江渔业资源管理委员会副主任到会并讲话。
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