我国作为一个养殖产量占世界总产70％的大国，入世以来，渔业经济发展的市场环境对我国水产养殖发展提出了更高的要求，提高质量、优化结构、实现可持续发展成为该阶段渔业发展的主题，水产养殖进入新的发展阶段，水产养殖可持续发展面临新的问题。
第一，政府调控失灵、市场信息不对称、结构调整滞后、发展失衡。政府微观干预过多，宏观管理不足，表现为一些地方忽视自身资源禀赋和市场区域的差异，盲目进行养殖结构调整。造成市场失衡、产销发展不同步，水产品供求矛盾突出，养鱼户收益下降。
第二，渔业水域环境污染日趋严重，一些地区为了短期经济效益不顾环境容量，盲目扩大养殖规模，增加放养密度，造成水产养殖病害频发，养鱼户经济损失加大。
第三，由于我国水产养殖多以分散的家庭经营为主，从业人员质量安全意识差，养殖凭经验，产业整体素质不高。
第四，养殖生产中不按要求使用饲料、渔药等投入品的现象普遍，养殖产品药残超标，质量安全达不到标准，产品出口受阻。
中国水产养殖发展存在误区。回顾水产养殖发展历程不难看出，正如我国经济整体发展一样，我国水产养殖发展在追求数量、追求增长速度的前提下，是以高成本、低效益换取的，是以透支未来的资源和环境为代价取得的。
误区一：在养殖方式上，中国水产养殖历史悠久，传统的综合养鱼方式一直被作为经验在东南亚、乃至世界其他国家广泛流传，这是中国水产养殖史上最具有记载意义的、光辉的一页。然而，在国际上普遍关注水产品质量安全、消费者崇尚绿色水产品的今天，一些水产专家、大学教授仍在讲台、培训班等不同场合乐此不彼地传播着讲了几十年的有机肥养鱼，难道泱泱水产养殖大国就只有这点“国粹”值得与国外交流吗？
误区二：在养殖品种方面，四大家鱼是我国水产养殖的当家品种，二十多年来，我们靠以“四大家鱼”为主的淡水鱼类养殖解决了国内市场对水产品大众化的需求。今天，中国水产养殖无论是面对国内市场，还是跻身于国际水产品贸易，无论从适应国内水产品市场的需求、促进农民增收，还是参与国际水产品市场竞争，都需要加快养殖结构调整步伐但是，面对养殖病害、市场供求失衡、贸易壁垒等一系列问题，养殖业的反应是不断地更换品种，试图靠新品种、多品种规避市场风险、病害风险，规避所面临的一切问题。这种急功近利的做法使我国的水产养殖业一直徘徊在一个低层次的发展水平上，既没有一个成熟的品种，也没有一个成熟的产业，更没有一个成熟的市场，发展失衡的产业经受着市场严峻的考验而呈现出大起大落的趋势，产品的国际竞争力受到限制，贸易战也就成了盲目发展的必然结果。
误区三：在养殖饲料营养方面，水产养殖饲料的革命仍遥遥无期。中国水产养殖饲料的利用率远远低于世界平均水平。近年来，海水鱼类养殖保持了较高的发展速度，且随着新一轮养殖热潮的到来，饲料的需求量将会越来越大。值得注意的是，网箱养殖一直沿用鲜活饵料，甚至连新兴起的深水抗风浪大网箱养殖也使用小杂鱼作为饵料，这些饵料除极少部分被利用外，大量的成为残饵，流失到自然海域；加之养殖鱼类排放的大量有机物，不但污染周围的水域环境，而且由于对海中幼鱼资源的大量捕捞，造成自然资源饵料基础的大幅度下降，直接影响了国家禁渔效果。
误区四：在经营形式上，虽然我国水产养殖发展市场化较彻底，但在以家庭承包方式为市场主体经营的前提下，我国水产养殖发展始终未形成一个真正意义上的产业，而是逐步走向小而全、高成本、低效率的小农经济，低品质、低价格的产品充斥市场，产业整体素质不高。水产养殖业的产业化、组织化水平较低，并成为制约养殖产品竞争力提高的瓶颈。
误区五：在宏观管理方面，政府和非政府管理和指导作用不明显，宏观管理弱化乃至虚化。政府部门在履行经济职能时，一方面表现为过多地参与了微观经济活动，干预了市场机制的有效发挥；另一方面，表现为宏观调控较弱，对市场经济下产生的外部不经济性，如水产养殖对公共环境造成的负面影响重视不够。一些政府的职能部门似“消防队”，人浮于事，穷于应急、堵漏，很少从整个体系、以及产业发展的各个环节上统筹考虑问题，战略思考少、思路不清、职能错位。（南方农村报）
，如水产养殖对公共环境造成的负面影响重视不够。一些政府的职能部门似“消防队”，人浮于事，穷于应急、堵漏，很少从整个体系、以及产业发展的各个环节上统筹考虑问题，战略思考少、思路不清、职能错位。（南方农村报
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