目前，我国食品安全面临的国际形势是食品安全事件频发、波及面广，食品安全成为各国政府和公众关注的焦点，食品安全不仅事关消费者的健康，而且影响了国际贸易。
一旦发生食品安全事件，国家将遭受重大经济损失。例如，英国牛肉因疯牛病出口受阻，每年损失52亿美元，宰杀损失300亿美元；1999年比利时二恶英污染事件损失达13亿欧元。食品安全事件造成贸易纠纷频繁。例如欧盟与美、加激素牛肉案，WTO裁定美、加每年分别损失1.16亿美元和1130万加元；欧盟向美、加出口税增加100%（惩罚性）。食品安全事件将造成严重的政治后果。例如，比利时的二恶英事件（1999年）导致该国政府内阁全体倒台；德国疯牛病（2001年）导致该国农业部和卫生部部长引咎辞职。
鉴于食品安全的重要性，各国纷纷加大科技投入，食品安全成为科研投入重点，在科技发展规划中将食品安全列为公共安全之首，不仅发达国家，发展中国家也是如此。
在我国，食品安全成为构建和谐社会、保障国家经济安全和公共安全的制约因素，受到我国政府高度重视，食品安全科技的发展也成为提升食品安全监管能力的核心支撑。目前，我国食品安全科技发展与国际相比还存在较大的差距。
首先，食品安全与否影响和谐社会的构建。
一是我国食品安全形势总体好转，但食品安全事件依旧时有发生。如猪链球菌食物中毒、福寿螺“管圆线虫病”、上海“瘦肉精”食物中毒、毒饺子事件以及三鹿奶粉事件（三聚氰胺）等。
二是缺乏科学的风险评估，食品安全事件有时被炒作放大，对社会和经济发展造成严重影响。如河北“红心鸭蛋” 和山东“多宝鱼” 事件。
三是微生物造成的食源性疾病仍然是食品安全的首要问题。
四是出口贸易受阻：氯霉素、孔雀石绿使我国动物源食品损失数百亿元；日本“肯定列表制度” 检测项目从100多项增加到600多项，对我国对日农产品出口造成极大影响。
其次，党中央、国务院高度重视食品安全。
胡锦涛总书记指出：保障食品安全是关系人民群众切身利益、关系中国社会主义现代化建设全局的重大任务。要树立全程监管理念，坚持预防为主、源头治理的思路，努力建立健全保障食品安全的长效机制。要切实完善食品安全监管体制和支撑体系，搞好食品监测基础设施建设，完善检验技术手段，加强食品安全宣传，完善食品安全信息发布机制。
全国人大代表高度重视食品安全，提出要把食品安全科技研究任务提升到人民共同享受改革成果的高度。国务院发布的《国家食品药品安全“十一五”规划》中，明确提出食品安全科技研究任务。
一是大力加强食品安全能力建设。包括完善组织机构：SFDA、MOH、 MOA、AQSIQ等共同负责食品安全；实施重大行动计划：“食品药品放心工程”、“国家食品安全行动计划”、“无公害食品行动计划”、“动物及动物源食品中残留物质监控计划”等；健全法律法规体系：《农产品质量安全法》、《食品卫生法》（修定）以及其他相关部门法规；实施重大科技专项，将食品安全列入国家重大科技专项，加强科技支撑体系建设，提供科技保障。
二是加强科技创新体系建设，为我国食品安全提供强有力的支撑。
科技攻关为食品安全提供了有力的支撑。“十五”期间，通过实施“食品安全关键技术”国家重大科技专项，抓住市场准入安全关键环节，以“反弹琵琶”的形式，加强技术攻关与集成，应用示范与对策研究并重，带动食品安全科技能力建设、人才培养和基地建设，研制出一批监测技术及产品；建立了全国监测网；标准研究和体系建设得到空前发展；初步形成了符合我国国情的食品安全保障模式，培育了一批食品企业品牌；培养了一批食品安全科技队伍。初步形成了我国系统的食品安全科技创新体系 。
国家政策为食品安全科技创新体系的长效发展提供了有力的保障。国务院颁布的《国家中长期科学和技术发展纲要》将食品安全列入公共安全领域优先主题，为加强食品安全科技攻关提供了有力保障。
我国在食品安全方面与国际上存在的问题和差距包括食品安全风险评估基础研究薄弱；食品安全标准体系不够完善，缺少科学基本数据；现行食品安全关键检测技术仍然比较落后；食品安全溯源预警体系尚不完善，食品中的许多污染情况 “家底不清”；食品安全控制技术体系在我国尚未得到广泛应用。
鉴于此，我国将以科技为支撑，以科学数据为依据，强化国家食品安全能力，建立有效的国家食品安全控制体系。其目的在于保障公众健康，构建和谐社会；维护国家贸易，提高核心竞争力。其中风险评估技术成为保障食品安全和公众健康的核心技术；食品安全关键检测技术趋向于高技术化、系列化，检测水平得到不断提升；食品安全标准是食品安全控制的重要基础，各国重视并加快实施食品安全标准化战略；食源性疾病与食品污染的监测、溯源和预警技术成为食品安全的重要保障；食品安全控制技术已成为各国共同遵循的模式（在推广GAP、GVP、GHP、GMP的基础上，建立以HACCP为原理的食品安全控制技术体系已成为加强食品链安全控制的最佳模式）；生物技术等高新技术成为提升食品安全科技原始创新能力的核心动力（以生物芯片为代表的高新技术的发展，带动了全新毒理组学技术的发展）。
我国发展食品安全科技工作的基础及优势是：创新能力整体提升；支撑体系逐步完善；控制体系基本建成；产业竞争不断增强；学科建设发展迅速；人才队伍初具规模；科研投入不断加强。
食品安全科技自主创新能力得到整体提升。主要表现为以下几点：
首先，多残留检测技术实现重大突破：农、兽药残留的多组分系列检测技术从过去检测50种增加到150种。
其次，标准制定改变国内历史：首次牵头制定“预防和减少树果中黄曲霉毒素污染的生产规范”国际标准。
再次，实验室能力验证得到国际认可：实现了从“应试学生”到“出题老师”角色的转变。
第四，快速检测技术实现跨越式发展：H5、H7、 H9等不同亚型禽流感病毒的荧光RT-PCR检测试剂盒的检测时间从21天缩短为4小时，建立了4项国家标准，获得了Ⅰ类新兽药证书。
第五，研制了一批食品安全监管需要的设备及产品：80多个检测技术相关试剂（盒）和25种相关检测设备，已经开始得到应用。食品安全监测车已在全国工商、质检、农业等系统推广应用，使得这些部门的执法水平发生了巨大变革，现场高技术执法成为可能，现已在各系统配备20多辆食品安全监测车，并在抗震救灾中发挥了重要作用。
食品安全科技设施和条件得到进一步完善。主要表现在：食品安全公共研发机构不断壮大；企业研发机构初具规模；一批新兴的食品安全学科基地正在形成；建立了一批适合我国区域经济和社会发展的食品安全保障模式。
培养了一支高水平的人才队伍。主要表现为：加速了科技创新人才队伍的建设；提高了检验检测人才队伍的水平；支撑了监督管理人才队伍的发展。
我国发展食品安全科技工作的指导思想是国家目标主导、整合多方资源；突破重点技术、加强集成应用；遵循科学发展、构建和谐社会。总体目标是按照贯彻落实科学发展观，以人为本，构建社会主义和谐社会的总体要求，建立符合我国国情的食品安全科技支撑体系，保证食品安全，保障人民健康，增强我国食品工业国际竞争力、实现食品安全保障从“被动应付型向主动保障型”的战略转变。具体包括以下几个方面的工作：第一，突破“四项技术”：风险评估技术、快速检测技术、溯源预警技术、安全控制技术；第二，完善“三个体系”：预警体系、标准体系、全程控制体系；第三，研发“二类产品”：设备、试剂；第四，推广“一个模式”：科技综合示范，最终形成符合我国国情的食品安全保障模式。
我国发展食品安全科技工作的重点任务包括：风险评估研究，风险评估技术、评估模型、基地；检测技术与前沿技术，残留前处理、耐药性监测、高通量检测、试剂及设备；溯源与预警技术，中毒诊断及处理、溯源、预警和监控网络；控制技术与标准，建立全程控制体系、制定标准及技术措施；综合示范与国际合作，建立和完善从“农田到餐桌”全程控制体系。
在食品安全风险评估研究方面，针对我国风险评估基础数据缺乏、风险评估技术还未能全面应用等问题，重点开展食品毒理学安全性评估技术、食品污染物暴露评估技术研究，建立和完善我国食品病原微生物、农兽药残留、化学污染物（含生物毒素）、新资源食品等风险评估技术体系，建立食品安全风险评估模型，培育风险评估研究基地。
在食品安全检测技术与前沿技术研究方面，针对我国目前检测技术比较落后的现状，重点开发食品危害物多残留前处理技术和检测技术与仪器设备，研究建立食源性微生物基因分型识别、细菌耐药性监测技术，研制相关检测试剂及重要标准物质。同时，瞄准生命科学和生物技术前沿，开展食品中有害残留物高通量表征关键技术研究，研发食品中致病微生物高通量检测技术、产品，探索代谢组学技术在食品安全检测中的应用。
在食品溯源与预警技术研究方面，针对我国食品安全溯源与预警体系不完善的情况，利用 “十五”国家重大科技专项“食品安全关键技术”建立的食品污染物监测网和进出口食品安全预警系统等成果和技术，重点开展重大活动食品安全保障、食物中毒诊断与处理技术、食源性病原微生物分子分型技术、食品危害物溯源与食品溯源技术以及食品安全突发事件的预警技术研究，建立国家食品安全溯源及预警监控网络体系。
在食品安全控制技术与标准研究方面，针对我国食品安全标准体系不够完善、安全控制技术体系尚未得到广泛应用的现状，在“十五”国家重大科技专项“食品安全关键技术”基础上，建立和完善我国重要食品安全标准数据库，并制定相关标准与技术措施，特别是与我国食品进出口贸易密切相关的标准与技术措施；研究食品生产、加工和运输过程中的控制技术，进一步提出实用、符合规范的食品安全控制体系。
在食品安全综合示范方面，针对关系国计民生、进出口食品或重大活动，选择典型地区或产业，在前期示范的基础上，将共性技术与相关政策和投入相结合，开展食品安全综合科技示范，建立和完善“从农田到餐桌”全程控制体系和食品安全保障体系，最终形成一套符合我国国情的食品安全保障运行模式，并加以推广应用。
在食品安全宏观战略与国际合作方面，为全面提升我国食品安全科技国际地位，积极参与食品安全国际规则的制定，维护我国食品贸易利益，跟踪国际食品安全动态，制定了符合我国国情且与国际接轨的食品安全科技发展政策，指导我国食品安全科技发展，加强食品安全科技战略研究，广泛参与国际合作。(科技部社会发展科技司司长 马燕合)
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